幽门螺旋杆菌治疗是慢性胃炎、胃十二指肠溃疡治疗的一个重要环节，主要作用是根除幽门螺旋杆菌、消除引起胃病的原因。治疗时间通常为1~2周。而慢性胃炎以及胃十二指肠溃疡的治疗，一个疗程通常需要4~8周的时间。因此，幽门螺旋杆菌治疗后仍出现胃疼，一方面可能与治疗时间过短、疗程不够有关系，另一方面，可能与复发有关系。患者需要继续进行治疗或第二个疗程的治疗。