萎缩性胃炎常常伴有肠化生改变，如果越来越严重，是容易发展为胃溃疡，长期演变可发展为胃癌。因此，需要进行积极正规的治疗。首先，要进行根除幽门螺旋杆菌治疗，可以采用三联或四联疗法，服用质子泵离子剂如奥美拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑、枸橼酸铋雷尼替丁、阿莫西林、甲硝唑或克拉霉素等。治疗两周以后停用抗生素，然后，继续服用质子泵抑制剂及胃粘膜保护制剂如硫糖铝、枸橼酸铋钾等进行进一步治疗，一个疗程为6-8周时间。然后进行复查，必要时进行第二疗程治疗。