阴道菌群失调主要是由于阴道内产生过氧化氢的乳杆菌减少，其他病原微生物大量繁殖导致的细菌性阴道病，这种病原微生物主要包括加德纳菌和厌氧菌。在治疗上，对抗厌氧菌的主要药物就是甲硝唑，所以可以口服甲硝唑、替硝唑或者克林霉素。同时也要尽量减少性生活的次数，避免阴道灌洗。对于顽固性的细菌性阴道病，也可以应用阴道乳杆菌活菌胶囊。