幽门螺杆菌会反复感染，但感染率不高，一般进行根除治疗后再感染率是1-5%。治疗后停药一个月，复查呼气试验阴性，以后1年、2年再复查都阴性才算阴性。因为正常成年人免疫力正常、抵抗力强，即便再感染，有90%以上的自发清除率。但有的病人，开始检查幽门螺杆菌阳性，经过治疗后复查时阴性，过一段时间又阳性了，这其中有一种情况就是其实治疗第一次没彻底根除，只是抑制了细菌繁殖，处于暂时休眠状态，检查时表现为假阴性，而不是再感染。