培菲康在临床上一般不用来直接治疗单纯便秘，但如果便秘和腹泻症状交替出现时，有时会配合使用。
培菲康是一个复方制剂，它里面主要有长双歧杆菌、嗜酸乳杆菌和粪肠球菌，主要用于肠道菌群失调而引起的腹泻或者腹胀，也用来治疗轻中度急性腹泻及慢性腹泻。它的治疗原理主要是直接补充正常生理性细菌，调节肠道菌群，能够抑制肠道中对人体具有潜在危害的菌类或者病原菌。