艾司奥美拉唑肠溶胶囊临床主要用于胃食管反流病的治疗，即反流性食管炎，以及已经治愈食管炎的患者预防、复发的长期治疗。可用于胃食管反流病的症状控制，与适当的抗菌疗法联合用药，可根除幽门螺杆菌，可愈合与幽门螺杆菌相关的十二指肠溃疡，预防与幽门螺杆菌相关的消化性溃疡的复发，可治疗长期使用非甾体类抗炎药所导致的相关性胃溃疡。
艾司奥美拉唑肠溶胶囊有效成分艾司奥美拉唑，对基础胃酸分泌和刺激的胃酸分泌均有抑制作用。由于本品对酸不稳定，因此制成肠溶胶囊可避免胃酸进行破坏。进食可延缓或降低该药的吸收，因此采取空腹服药，常见的不良反应有头晕、头痛、口苦、腹泻、腹痛，以及皮疹、面部浮肿、干咳、转氨酶一过性的升高等。这些均为比较轻度，不需要对症处理，也不需要停药，可短期内恢复。