毛石肠梗阻综合征的病因主要是长纤维物质的吞入而不能被机体所消化，在胃蠕动的机械力作用下缠绕成团形成毛石，引起高位肠梗阻或幽门梗阻。
主要由于有异嗜症或精神病者而好咀嚼吞咽头发、丝线类物等长纤维物质，这些物质吞入胃后不能为机体所消化，在胃蠕动的作用下缠绕成团形成毛石，随着胃内容物向小肠推进，毛石的尾端可经幽门进入空肠，因其缠绕较紧难以继续向前推进时，在胃和空肠上段逐渐增大，引起高位肠梗阻或幽门梗阻，毛石常压迫小肠壁的系膜侧，引起坏死，甚至穿孔。