1、体格检查：查看皮肤黏膜是否苍白、眼睛内侧是否出现粉色、甲床是否发白等，判断病人是否有贫血表现。检查患者腹部，查看病人是否有胃部的压痛。
2、血常规检查：常规检查外周血细胞计数、血红蛋白浓度、血小板数量以及形态、血细胞比容、红细胞形态等，是否出现贫血、贫血类型以及贫血的严重程度。
3、幽门螺杆菌检测：常用的方法有尿素呼气试验和快速尿素酶试验。尿素呼气试验为无创性检查，依从性比较高，准确性良好。
4、胃液分析：抽取胃液，对胃液的量、成分以及酸碱度等进行分析，了解胃分泌功能，有助于消化系统疾病的诊断和治疗。
5、胃蛋白酶原测定：胃蛋白酶原是由胃底腺的主细胞分泌的，当发生重度萎缩性胃炎时，胃底的主细胞会减少，胃蛋白酶原含量一般会减少。
6、血清胃泌素测定：血清胃泌素的测定有助于区分A型重度萎缩性胃炎和B型重度萎缩性胃炎。一般A型重度萎缩性胃炎血清胃泌素明显增高，而B型胃泌素则降低。
7、血清抗壁细胞抗体、内因子抗体以及维生素B12水平测定：有助于诊断自身免疫性胃炎，A型重度萎缩性胃炎一般血清抗壁细胞抗体阳性、内因子抗体阳性、维生素B12水平低于正常。
8、胃镜检查：重度萎缩性胃炎在胃镜下观察到黏膜色泽变淡、黏液减少、黏膜变薄，有时可以透见黏膜血管纹。
9、病理组织学活检：对于重度异型增生和原位癌患者与重度萎缩性胃炎在胃镜下难以区分，可用病理组织活检进行区分。