胃肠神经官能症的治疗方法如下:1.精神症状明显者予抗抑郁或抗焦虑、调节胃肠道植物神经的药物治疗如多虑平、安定、氯丙嗪、氟哌噻吨、谷维素等。2.腹痛者予抗胆碱能药物和或钙离子拮抗剂解除胃肠道平滑肌痉挛如阿托品、颠茄制剂、普鲁本辛、解痉灵和匹维溴铵、奥替溴铵等。3.呕吐明显者可用维生素B6、吗丁啉、胃复安、异丙嗪等止吐。4.便秘者可用石蜡油、乳果糖、益生菌等润肠通便、调节肠道菌群失调。5.腹泻者可用复方苯乙哌啶、易蒙停等药物治疗。