克隆氏病是炎症性肠病的一种，属于肠道的自身免疫性疾病，一旦确诊是需要长期治疗。一般的治疗包括注意休息，少渣饮食，减少精神压力，营养支持的治疗。药物治疗主要包括5-氨基水杨酸1克，1天3次到4次，脓血便严重的患者则需要激素治疗，开始的时候可以静脉应用激素，缓解症状之后可以小剂量口服维持。病情严重的患者则需要硫唑嘌呤等免疫抑制剂的治疗，甚至应用生物制剂。部分患者则需要手术治疗。