检查无痛胃肠镜是不痛苦的。无痛肠镜室被检查者在静脉应用麻醉药后，将人体麻醉，使人体处于无意识的状态，被检查者不再有疼痛的感觉。如果患者有呼吸暂停综合征、打鼾喘鸣等都不适宜做无痛麻醉。年龄偏大或者偏小，心肺有严重功能不全患者、妊娠或者是不能合作者，也不适合做无痛麻醉。现临床上无痛麻醉通采用静脉推注丙泊酚，丙泊酚在静脉推0.5到1分钟即可出现意识消失，停药后即可唤醒，且清醒迅速，意识及定向力即恢复正常。