矮小症缺乏维生素D以及钙、铁、锌等微量元素。
小症是由多种原因引起的，与缺少生长激素有关，如父母或家族中有身高矮小者，则会导致儿童出现矮小症。此外，与垂体器官先天长的较小有关，比如先天性脑垂体瘤、垂体有囊肿、垂体器官先天长的较小等，都会引起垂体分泌生长激素，甲状腺功能减低症等。
儿童在成长的过程中，如果缺乏钙、铁、锌等微量元素，或缺乏维生素D，就会导致儿童缺乏微量元素、营养不良，从而导致儿童出现矮小症。