婴儿多指畸形主要跟遗传因素有关，具体如下：
父母家庭成员中有多指畸形病人，子女多指畸形的概率就会增加。孕期母亲受到电离辐射，如X线、CT检查等，可能损伤胚胎。孕期母亲用了致畸药物也会导致多指畸形。母亲生活习惯不好，如吸烟、喝酒容易导致多指畸形概率增加。腹部创伤导致胎盘受损也会使多指畸形发生的概率增加。