婴儿打完乙肝第2针可能会有发热、乏力、嗜睡、注射部位短暂疼痛、发红、肿胀等副作用。宝宝注射乙肝第二次注射后会出现身体的免疫功能降低的情况，进而可能会出现上述不适症状。但如果婴儿的身体素质较好，可能不会出现上述症状。
如果在打完乙肝第2针后，出现了发热、乏力等症状，应及时就医检查，必要时可遵医嘱使用相应的药物进行治疗。