婴儿溶血主要是由于母子血型不合，体内产生与胎儿血型抗原不配的血型抗体。
这种抗体会通过胎盘进入到胎儿体内引起同族免疫性溶血，常见Rh血型和ABO血型系统的血型不合。新生儿期其他因素导致的溶血的原因还有红细胞酶或红细胞膜的缺陷。新生儿溶血病的病因是母亲和胎儿间的Rh血型不合与ABO血型不合，如果胎儿由父亲遗传来的血型抗原是母亲所没有的，胎儿红细胞进入母体后使母亲产生相应的抗体，这些抗体再通过胎盘进入胎儿体内导致抗原抗体的免疫反应发生溶血。