男孩生殖器疼痛主要表现在包皮龟头炎、尿道炎、膀胱炎等疾病上，建议去泌尿外科、小儿外科，通过体检、尿常规、泌尿系彩超等检查，明确生殖器疼痛的病因。
建议日常注意保持局部清洁，每日用温水擦拭外阴。也可以在医生指导下采取包皮环切术，如包皮过长、包皮炎、包茎等。如果是尿道炎和膀胱炎的病人，要注意多饮水，定期排尿，并进行系统的抗炎治疗。