新生儿虽然从母体获得的免疫球蛋白有被动免疫作用，但仍然对很多传染病是高度的易感者，计划免疫对婴幼儿帮助很大，防止危害婴儿最大的传染病很有必要。
新生儿期接种的疫苗之一是卡介苗，接种后6-8周会出现特异性变态反应，接种试验呈阳性；新生儿的预防接种疫苗还有乙肝疫苗，出生时和出生后的一个月、六个月都要接种一次，得到较好免疫应答的效应。