导致小儿秋冬季腹泻的常见原因是消化系统发育不成熟，酶的活性差，营养需求高，肠道负担重，吃太多淀粉类、脂肪类食物，会导致消化功能紊乱，从而引起腹泻。
1、免疫力低，小儿神经系统、分泌系统、循环系统、肝肾功能不成熟，性能差，免疫功能不成熟，病原菌随食物进入人体导致腹泻。
2、轮状病毒感染，这是导致小儿秋季腹泻的主要原因，人工喂养的小儿较常见，喂养时用的器皿和食物，没有消毒或消毒不彻底，可能感染病毒。
3、呼吸道或水源感染，这种情况在8-12个月时多发，以10-11个月达到高峰，因为温差大，忽冷忽热，容易导致感冒腹泻。