有些孩子在肠套叠后，经过保守的整复，可以避免复发，但也有少数的孩子会复发。
肠套叠后局部的肠管壁水肿，引起复套，这是一种常见的病因，尤其是在肠套叠后，穿孔后，局部水肿，造成肠套叠前度。肠套叠经过保守整复后，胃肠功能失调而引起的复套。器质性的原因导致的肠套叠，引起腹部疼痛，必须通过手术来根治。如果单纯的进行保守的观察，是无法根治的，最常见的就是器质性疾病。