新生儿出血症的患者大多都有良好的预后，不会留下任何的后遗症，通常十多日内就会停止流血，不会再出现。
出血的部位、程度以及治疗的时间长短可能会对身体造成影响。如果出血量过大，耽误了治疗时间，很有可能会造成病人的生命危险。颅内出血的预后要好很多，少量的血液可以自行消化，但是出血的数量多，对人体的伤害也会很大，有很大的几率会造成致命的后果。脑部出血可能会留下智力低下、癫痫、脑性瘫痪等问题。