小儿扁桃体炎跟营养不良、佝偻病、消化不良、缺乏锻炼、过敏体质有关，小孩免疫力低容易患扁桃体炎。有原发性的免疫缺陷或后天免疫功能低下，抵御病原微生物的能力低就容易患急性扁桃体炎。
小儿患扁桃体炎全身感染症状明显，发烧可能高39度-40度，伴有寒战、恶心、呕吐、全身乏力、头痛及全身痛、食欲不振的症状。有的因高烧导致惊厥，检查咽部扁桃体有脓。小儿扁桃体发炎可能说自己嗓子疼、咽东西疼、咽水疼。小儿张嘴压住舌头能看到咽部有两个红肿的扁桃体，有的可能有脓，肿大得厉害会导致呼吸困难甚至危及生命。