婴儿扁桃体发炎发烧应积极查明病因，针对病因进行治疗。
小儿扁桃体炎急性发作期，患儿会出现高热症状，如果患儿持续发烧五到七天以上，需及时到医院通过血常规检查、细菌培养检查以明确病因，对症治疗。
如果是病毒引起的，可采用抗病毒药物进行治疗，如果是细菌感染引起的，可采用抗菌药物进行治疗。其次给予退热处理，通常发热低于38度五时，医生会主张采取物理降温的方法，若是体温超过38度五时，可以服用退热药物。另外，扁桃体炎急性发作期，饮食宜清淡，可早晚用淡盐水漱口。