一般来说，直肠给药对孩子没有太大影响。
通常宝宝吃药配合性差，口服药不容易灌进去，比如说发热、高烧，有时候伴有呕吐，不能通过口服给药，这时可以通过直肠给药。
一些药如退热栓，开塞露，它的设计就是为了直肠给药的途径而设计的，这种药直肠给药很安全。另外一些刺激性比较大的药，对胃肠道刺激很大，气味难闻，孩子难以下咽，它也可以通过直肠给药。
直肠给药插管时造成直肠黏膜的损伤，或者是一些刺激性大的药物会造成直肠粘膜水肿，但通常这些副作用不是太严重的。