通常情况下，小儿化脓性扁桃体炎病程是3-10天左右。
小儿化脓性扁桃体炎一般是溶血性链球菌感染引起的，早期一般表现为持续高热、咽痛，而后当扁桃体处出现脓性斑点，主要是革兰氏阳性球菌感染导致，可以使用青霉素类的抗生素治疗。一般3到5天体温可以恢复正常，但是如果孩子扁桃体仍然有红肿，脓苔不一定会马上消退，这时候仍需继续治疗，直至脓苔消失，总的疗程可能会达到10天。
化脓性扁桃体炎一般不建议过早停药，以免治疗不彻底，引发心肌炎、急性肾小球肾炎。