通常情况下，川崎病的后期要注意心脏的损伤。
因为川崎病可能会造成儿童的冠状动脉的扩张，还有冠状动脉瘤、心律失常的损伤。所以一般需要定期给患者检查心电图。其次，是继续应用抗凝药物，因为在川崎病的后期，通常也会造成患者的体内存在高凝状态。此时，往往仍然需要长期的应用潘生丁、阿司匹林等药物进行治疗。并且需要在应用抗凝药物的同时，要注意给患者动态检查血小板计数，血沉，凝血功能等。