三十一个月的宝宝缺乏维生素D，建议通过食物、日晒、药物等方面进行补充，具体内容如下：
1.食物：三十一个月的宝宝缺乏维生素D，通常能够从食物中摄入一定量的维生素D，例如平时多吃一些动物肝脏、蛋黄、深海鱼类等维生素D含量丰富的食物，补充维生素D。
2.日晒：三十一个月的宝宝缺乏维生素D可以每天坚持半小时左右的日光照射，能够有效的促进体内维生素D更好的吸收。
3.药物：三十一个月的宝宝缺乏维生素D还可以在医生指导下通过药物补充，如维生素D片、鱼肝油等。