通常情况下，宝宝得了疱疹性咽炎可以吃清热解毒的药物，比如口炎清颗粒、蒲地蓝口服液等。而对于合并有周围口腔、咽喉部黏膜急性感染的宝宝，一般可酌情联合使用抗生素抗感染，常用青霉素类、抗菌素、头孢菌素类的抗菌素。但如果宝宝呈现反复出现的高热症状，还可以使用一些退热的药物，比如布洛芬混悬剂。
宝宝如果长时间吞咽困难，出现脱水、体力不佳的情况，还可酌情考虑，输液行补液及支持治疗。