三个月的宝宝肠炎主要可能是发育不全、抵抗力差、病菌感染等因素引起的，具体内容如下：
1.发育不全：三个月的宝宝的器官功能发育不成熟，各项功能较差，容易外来环境刺激，引起肠炎；
2.抵抗力差：宝宝的肠道抵抗叫擦较差，如果饮食不当或者局部受凉，女孩引起宝宝肠道屏障功能降低、肠壁通透性增高，从而诱发肠炎；
3.病菌感染：三个月的宝宝出现肠炎，多看是病毒及细菌感染引起的，如轮状病毒、诺如病毒、柯萨奇病毒、大肠埃希氏菌等，容易侵袭肠道黏膜，造成肠黏膜损伤，出现肠炎的表现。