一般来说，起水痘高烧39℃可以通过一般治疗、药物治疗等方式进行治疗。具体分析如下：
水痘是由于人体感染水痘—带状疱疹病毒，导致引起的一种急性的、传染性极强的疾病。如果起水痘高烧39℃，应当应用退烧药物将体温降到正常，家长可以遵医嘱给孩子使用乙酰氨基酚、布洛芬等药物进行治疗，还可以配合温水浴、毛巾擦拭等方式给孩子进行物理降温。此外，还可以使用阿昔洛韦片口服抗病毒。治疗期间应该规律作息，避免熬夜，注意休息。