目前自闭症病因并不明了。可能与遗传因素有关，最有名的就是对双生子，即双胞胎的研究，如果是单卵双生子，他们的同病率，即两个胎儿同时患自闭症的概率可以达到82%，如果是双卵双生子，同病率可以达到10%。与围产期的高危因素有关，比如在围产期，就是怀孕或出生的时候有感染，或者存在早产的因素，这些孩子发生自闭症的几率会增高。与神经系统的发育有关，自闭症孩子的大脑某些功能区发育的不是很好。