新生儿查过敏原的检查方法主要有抽血化验和皮肤点刺试验两种。
1.抽血化验：抽血是一种很常用的检查方式，一般都是从静脉中抽取血，这样就能知道新生儿是否存在过敏，是否存在食入性或吸入性的过敏原，比如花粉、尘螨、牛奶、花生等。
2.皮肤点刺试验：皮点刺试验也是一种检查新生儿对某一种物质是否过敏的方法，它是在新生儿的皮肤上滴一滴高浓度的过敏原，然后用一根细细的针头扎进皮肤的浅层，就能看到有过敏原渗入到皮肤中，这样就能知道有没有过敏反应了，这个方法比较精确，但会造成一些伤害。
需要到医院做进一步的检查，才能知道是否存在过敏原的问题。