3个月宝宝便秘可能与饮食不合理、肠道菌群失调、胃肠道发育不成熟等因素有关，建议家长在医生指导下明确病因后，针对治疗。
1.饮食不合理：如果一次性喂养的奶量过多，会增加胃部的负担，导致食物在胃肠道中积聚。需要采取少量多次的喂养方式，同时根据宝宝的需求进行喂养。
2.肠道菌群失调：如果肠道内的有益菌数量减少，会影响肠道的正常功能，可能引起腹胀、腹痛等症状，并导致干结的大便。在医生的指导下，可以服用双歧杆菌三联活菌胶囊、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物来缓解症状。
3.胃肠道发育不成熟：三个月大的宝宝胃肠道尚处于发育阶段，食物进入后消化和吸收不够完善，导致粪便在肠道中滞留。按摩腹部可以按顺时针方向进行，有助于促进胃肠道蠕动。
此外，便秘问题也可能与肠道梗阻等原因相关，因此及时就医并进行诊断是很重要的。