手足口病疫苗注射后发热考虑为疫苗不良反应。由于疫苗大多都是减毒活疫苗，部分孩子接种疫苗后，会出现发热、起皮疹等症状，可根据患儿发烧的程度进行退热治疗。
1、体温低于38.5°C：可采用物理降温的方法，对颈部、腋下和大腿根等部位进行温水擦浴，利于散热，还可粘贴退热贴、大量饮水、小便等、排汗均有助于体温较快降低，给予儿童轻而易消化的饮食。退热时注意保温，以免体液丢失过多而引起失温；
2、体温超过38.5°C：考虑退热药的使用，可按医嘱给予口服退热药如对乙酰氨基酚、布洛芬等。2次吃退热药的间隔时间不少于4小时，其间敦促患儿在物理降温的前提下大量饮水。