新生儿喝奶时喉咙打呼噜的原因可能是因为鼻腔空间狭小，喉部囊肿和喉软骨发育不全，还有上呼吸道感染。建议父母及时将新生儿带到医院新生儿科进行检查，并在医生指导下进行治疗。
1、鼻腔空间狭小：新生儿喝奶时喉咙打呼噜的声音可能是由于新生儿发育不全、鼻腔空间狭小、同时鼻腔与喉咙连通所致，喝牛奶要呼吸，这时空气经过鼻腔较窄的地方，会出现喉咙打呼噜的现象。此症不需特殊治疗，鼻腔随年龄增长而变大，使症状好转；
2、喉部囊肿：新生儿在喝牛奶时喉咙会打呼噜，这可能是因为囊肿发生在喉部。由于囊肿影响到新生儿正常的吞咽功能，从而使得喝奶时空气经过此处发出响声。父母要带新生儿到医院做喉镜检查和体格检查，诊断明确后在医生的指导下行囊肿切除术等术；
3、喉软骨发育不全：母亲妊娠时营养不良或新生儿为早产儿均可引起新生儿喉软骨发育不全，可使喉腔变窄，因而发生新生儿饮奶时喉鸣现象，造成新生儿饮奶时喉咙呼噜鼾地作响。平时不需要特殊治疗，新生儿2-3岁左右就会自行减轻，还可遵医嘱，适当晒晒太阳，喝点牛奶，补充钙质，促进喉软骨的发育；
4、上呼吸道感染：新生儿如发生上呼吸道感染，可导致喉咙内出现痰液，从而影响其正常呼吸和吞咽功能，由此而产生新生儿喝了奶嗓子打呼噜的声音，并可伴随着咳嗽和发烧。可遵医嘱口服抗生素类药物，例如头孢克肟颗粒和阿莫西林颗粒。
应注意，如已明确需用药处理，则建议其家属应严格遵医嘱。否则可因药物使用不当而影响新生儿身体健康。