三岁宝宝吃手指的原因包括生理性、病理性及心理性因素。生理性原因是因为孩子年幼，基于好奇、无聊或缺乏关爱等因素，导致养成吃手指的习惯。病理性因素是因为孩子出现挑食、偏食、营养不均衡及慢性疾病导致的微量元素缺乏，如缺铁、缺锌等，会出现吃手指甚至是异食癖等症状。
心理性因素是因为孩子可能身处陌生环境、家庭氛围严苛或自身有性格内向等因素，导致孩子处于紧张、焦虑的心理，会出现吃手指的现象。因此，当孩子通过日常生活中的改善不能解决吃手指情况时，需要考虑疾病或心理等因素，建议至儿童保健科明确病因，对症治疗。