脊髓灰质炎疫苗分为注射脊髓灰质炎灭活疫苗、口服脊髓灰质炎减毒活疫苗，副作用会有一定的区别。
1、注射脊髓灰质炎灭活疫苗：注射部位会有疼痛、红斑、硬结、一过性发烧等副作用，也有一些人在注射部位会有淋巴结肿大、亢奋、嗜睡、抽搐等症状，但通常3天左右就会消失。有些人也会有对疫苗的过敏性反应，比如皮疹，甚至于休克。
2、口服脊髓灰质炎减毒活疫苗：大部分患者没有任何副作用，少部分患者出现轻度发热、恶心、呕吐、腹泻、皮疹，一般不需要特别的治疗。只有少数人出现严重的副作用，才会出现发热、急性弛缓性麻痹等小儿麻痹症，需要及时就医，对症处理。