小孩反复高烧39℃以上,最常见的疾病是感染因素造成的,其中比较高发的是病毒感染或细菌感染，需要对症治疗。
高热会引起流感病毒、呼吸道合胞病毒、疱疹病毒等。通过临床症状来判断病毒感染的种类，从而做出相应的治疗。也有一些高热是由于细菌感染引起的，比如化脓性扁桃体炎，通常是由于溶血性链球菌引起的，这种情况下可以通过抗炎治疗来缓解。
除此之外，在小儿中也有很多发热性疾病，比如川崎病、EB病毒感染，这些疾病除了会出现反复发热外，还会出现皮疹、颈部淋巴结肿大等症状。除了反复发热外，还会出现关节肿痛、贫血、出血等症状。因此导致发热的原因比较多，有可能是感染，也有可能是非感染，这要根据患者的临床表现和相关的检查结果来进行判断。