男性生殖器长水痘跟水痘的治疗是一样的，可以给予抗病毒治疗。对症口服中药制剂，比如蒲地蓝口服液，西药可以选择阿昔洛韦片口服。病情及中毒症状很重的，患者出现头疼，周身疼痛，食欲减退，甚至恶心，呕吐，腹痛，也可以静脉注射阿昔洛韦。男性生殖器长了水痘，可以局部涂抹一些阿昔洛韦软膏或者抗生素软膏。局部瘙痒比较严重的可以涂抹炉甘石洗剂。