手足口病主要传染源是患者和隐性感染者。患者和隐性感染者以及病毒携带者的粪便，呼吸道分泌物及患者的粘膜疱疹液中均含有大量的病毒，当接触患者，隐性感染者等污染过的手，日常用品，衣物以及医疗器械等均可造成他人感染。该病传染性极强，隐性感染者较显性感染者明显多，二者比例大约100：1。因此隐性感染者是更为主要的传染源。