儿童室间隔缺损手术的费用主要取决于患者的年龄，患者的病情严重程度以及医院等级。以三甲医院来说，如果病情较为严重，需要在年纪很小的时候就做，那么脏器发育不完善，住院时间会比较长，总体费用就可能会需要四五万元。如果是在3~5岁，没有肺动脉高压，做介入手术的费用，一般在3万元左右。如果同时合并有肺动脉高压，后续恢复速度会比较慢一点，费用就有可能会需要6~8万元。