判断宝宝矮小症主要有以下依据：第一，孩子每年生长速率低于4~5厘米，身高低于同年龄同性别的儿童两个标准差。第二，孩子可能伴有特殊面容，比如头小而圆、眼距宽、面容幼稚等。第三，检测骨龄显示孩子落后于实际年龄两年以上。第四，患儿检测生长激素可能发现生长激素水平低。第五，患儿患有先天性甲状腺功能减低症、先天性肾上腺皮质增生症或皮质醇增多症等可引起矮小症的疾病。