新生儿败血症容易导致中枢神经系统感染或者坏死性小肠结肠炎。中枢神经系统感染可以并发脑室管膜炎、硬膜下积液、脑积水等，最终导致智力障碍、脑细胞坏死出现继发性癫痫、听力或者视力障碍、肢体运动障碍等后遗症。如果出现坏死性小肠结肠炎，有的还需要外科手术治疗，孩子可能会出现营养不良、短肠综合征等后遗症。所以新生儿败血症要及早发现，及早治疗。