新生儿窒息复苏的并发症主要是由于缺氧引起的全身各系统损害。是可能出现的损害，不一定都出现，有的并发症经治疗后可痊愈。神经系统：脑细胞损伤，轻者肌张力减低，反应迟钝，生长发育迟缓，重者智力低下，抽搐、癫痫、甚至脑瘫等；消化系统：胃肠道黏膜缺血、坏死，甚至会发生坏死性小肠结肠炎；呼吸系统：肺组织损伤，肺水肿、肺出血，肺动脉压力高等；肝脏：凝血因子产生减少，影响凝血；心脏：缺氧影响心肌和传导系统，出现心力衰竭、心律失常等。