新生儿肺炎用头胞的副作用，可能会引起肠道功能不适，有可能也会让新生儿出现中毒、新生儿出现皮疹、引发哮喘、过敏性休克等现象。头孢类的抗生素对新生儿也可能会有肾毒性，会引起肾脏受到影响，如果是有特殊原因的情况下，需要在医生的建议下使用头孢。如果是新生儿没有存在细菌感染，导致滥用抗生素的情况下，也会容易产生耐药性。