两个月婴儿上呼吸道感染最主要的原因是病毒感染引起，还有一小部分原因是细菌感染引起。病毒感染大多通过飞沫进行呼吸道的传播，也有可以通过接触含有病毒的体液经口传播。比如父母有人得了上呼吸道感染，病毒就容易传染给婴儿。细菌引起的上呼吸道感染，是因为我们的鼻腔口腔都有细菌的存在，平时不致病，当我们免疫功能低下的时候，这些细菌就会变成致病菌引起上呼吸道感染。