婴儿房间隔缺损面积较小者在4岁以内有15%的自然闭合率。缺损面积较大时心脏血液分流量大，会导致肺循环血流量增加、体循环血流量不足，表现为身高体重增加缓慢、面色苍白、反复呼吸道感染。因为房间隔缺损在成年后容易发生心力衰竭和肺动脉高压，如果4岁以后缺损未闭合，应及时选择手术修补。另外部分儿童年龄大于两岁，缺损面积大，如缺损边缘至上下腔静脉的话，应及早介入或手术治疗。