造成唇裂的可能原因很多，且目前尚不完全明确，父母或者直系亲属有唇裂，孩子出现唇裂的可能性比较大，但唇裂并非一定会遗传。孕期缺乏维生素、吸烟或者被动吸烟、喝酒都会提高胎儿唇裂的发病率。有一些药物如反应停、抗组胺药等在孕早期通过口服进入到胎盘中，会引发包括唇裂在内的胎儿发育畸形。怀孕前三个月患有风疹等病毒感染性疾病也会增加胎儿唇裂风险。