三个月婴儿出现耳朵有黄脓水的情况，首先需要尽量将患儿耳朵内的黄色脓性分泌物清理干净，可以使用蘸水的湿棉签进行清理，家长如果自行清理的话，需要使用手电等光源进行良好的照明，同时，要在可视范围之内进行操作清理，避免损伤耳道及鼓膜。如果耳道深部仍然有明显的脓性分泌物，就需要到医院进一步清理，同时对耳道及鼓膜进行仔细的检查，如果发现有外耳道或中耳的炎症，就需要进行相应的抗感染治疗。