导致孩子囟门闭合晚主要疾病有维生素D缺乏性佝偻病、甲状腺功能低下、21-三体综合征、脑积水等。如果没有这些疾病，单纯囟门的闭合晚，可能引起宝宝的头围略增大，但对于智力和运动等发育基本没有不良的影响。如果是由于疾病所引起的囟门闭合晚，就可能会出现智力、运动等方面的发育落后。因佝偻病引起的囟门闭合晚，会导致宝宝的骨骼改变和免疫力低下。