矮小症是指在相似环境下，身高（身长）小于同种族、同年龄、同性别儿童身高（身长）的正常参考值2个标准差或第3个百分位者，儿童的身高受遗传因素、宫内发育、出生时体重和身高、营养和内分泌激素等因素的综合作用。儿童矮小症病因包括遗传性或家族性矮小、体质性生长和发育迟缓、营养不良、慢性系统性疾病、宫内发育迟缓、内分泌疾病、染色体异常，骨和软骨发育不良、精神因素、特发性矮小，其中内分泌疾病，家族性矮小，体质性生长和发育迟缓，特发性矮小是矮小症的最常见原因，具体分析如下：1、体质性生长和发育延迟：以男童多见，多在1-2岁后出现生长缓慢，骨龄落后，一般多有发育延迟的家族史，内分泌功能检测正常，生长激素激发试验示部分性或暂时性生长激素缺乏，青春发育后其终身高和性成熟达到正常水平。2、慢性系统性疾病，患有一些慢性疾病，如慢性肝炎、慢性肾炎、先天性心脏病、慢性感染等都可以引起矮小症的发生，特别是肾小管酸中毒或者肠道功能紊乱引起的矮小不易被发觉。3、宫内发育迟缓，宫内发育迟缓的发生与孕母、胎盘和胎儿本身因素有关，其中孕母的因素包括低体重、妊娠期严重呕吐致营养不良、妊娠高血压疾病及其并发症、严重感染、吸毒、吸烟等。4、内分泌激素分泌异常，生长受到多种内分泌激素和因子的调节，许多内分泌紊乱可以导致矮小症。（1）生长激素缺乏，生长激素是调节生长的关键激素。（2）甲状腺功能减退也是导致矮小症的重要原因。（3）糖皮质激素过多。5、染色体异常，与儿童矮小有关的最重要的染色体遗传性疾病是先天性卵巢发育不全症。6、骨和软骨发育不良，影响升高的骨和软骨代谢性疾病较多，其中最常见的为先天性软骨发育不良。7、特发性矮小，矮小症患儿排除各种常见相关疾病后仍不能明确原因者称为特发性矮小。8、其他因素，如家族遗传、精神因素、营养因素等都可以引起矮小症的发生。